El Instituto de Segunda Enseñanza de la provincia de Huelva, hoy Instituto La Rábida, fue fundado por Real Orden de 13 de junio de 1856 de la Reina Isabel II. En sus ciento cincuenta años de historia ha pasado por numerosas sedes, la primera el Convento de San Francisco, hoy Iglesia de los Jesuitas; el Convento de la Merced, hoy Universidad, que en Huelva se le conoce como Instituto Viejo; y la actual en la Avenida de Manuel Siurot desde el curso 1933-34.

Tras los daños causados por el terremoto de Agadir, el Instituto repartió sus aulas por varios locales, para asentarse finalmente en un edificio de nueva planta, hoy IES Alto Conquero en el que permaneció hasta el año 1978, año del regreso a su sede actual de la Avenida Manuel Siurot.